LCA 2 - Essai diagnostique

Tests qualitatifs et quantitatifs

• Test qualitatif
• Résultat:
• binaire (dichotomique): + ou – (ex: crachats BK)
• nominal: échelle sans hiérarchie (ex: groupes sg: A/B/AB/O)
• ordinal: échelle hierarchique (ex: grade I/II/III)
• → évaluation de la reproductibilité par coefficient kappa (κ)
• Test quantitatif
• Résultat
• toujours une valeur numérique continue (ex: glycémie)
• problème = valeur seuil normal / pathologique
• → détermination de la valeur seuil par courbe ROC (+/- Pearson / Bland-Altman)

Tests de dépistage et de confirmation

Conditions pour le dépistage de masse (OMS) +++

• Maladie
• fréquente / grave / problème de santé publique
• curable si diagnostic précoce / ↓ mortalité
• latent: évolution naturelle connue et lente
• Population cible
• connue: données démographiques (ex: femmes entre 50 et 75ans)
• accessible / mobilisable / dépistage ressenti comme un besoin..
• Tests
• test de dépistage: validé / simple / acceptable / peu coûteux / reproductible
• test de confirmation: existant / validé / acceptable

Quelque soit le paramètre évalué

• Tableau de contingence +++

• !! Pour que l’article soit valable, vérifier
• La présence d’une définition précise et valable pour FP/FN/VP/VN +++
• La représentativité de l’échantillon: critères de sélection / prévalence

Sensibilité (Se) / Spécificité (Sp)

• !! Paramètres intrinsèques =  ne dépendent pas de la prévalence
• Mais dépendent du seuil si quantitatif (cf courbe ROC: infra)
• Déterminent (avec RV) la validité intrinsèque du test
• Sensibilité (Se)
• Se = probabilité d’avoir un test positif si patient malade
• Se = p(T+/M+) = p(T+ ∩ M+) / p(M+) = VP / (VP+FN)
• Spécificité (Sp)
• Sp = probabilité d’avoir un test négatif si patient sain
• Sp = p(T-/M-) = p(T- ∩ M-) / p(M-) = VN / (VN+FP)
• Remarque: indice de Youden
• Y = Se + Sp – 1 ; permet un aperçu global

Valeur prédictive positive (VPP) / négative (VPN)

• !! Paramètre extrinsèques = dépendent de la prévalence
• Déterminent la validité extrinsèque du test
• On a VPP = RVP x prévalence
• Valeur prédictive positive (VPP)
• VPP = probabilité d’être malade si le test est positif
• VPP = p(M+/T+) = p(M+∩T+) / p(T+) = VP / (VP+FP)
• Valeur prédictive négative
• VPN = probabilité d’être sain si le test est négatif
• VPN = p(M-/T-) = p(M-∩T-) / p(T-) = VN / (VN+FN)

Rapport de vraissemblance positif (RVP) / négatif (RVN)

• RV = LR: Likelihood Ratios
• !! Paramètres intrinsèques: ne dépendent pas de la prévalence
• Déterminent (avec Se/Sp) la validité intrinsèque du test
• RVP (= RV d’un test positif)
• RVP = combien de fois plus vraissemblable d’être M+ sachant qu’on a T+
• RVP = p(T+/M+) / p(T+/M-) = (VP/M+) / (FP/M-) = Se / (1-Sp)
• Exemple: RVP = 5 → le patient a 5x plus de chance d’être malade si T+
• RVN (= RV d’un test négatif)
• RVN = combien de fois plus vraissemblable d’être M- sachant qu’on a T-
• RVN = p(T-/M+) / p(T-/M-) = (FN/M+) / (VN/M-) = (1-Se) / Sp
• Exemple: RVN = 0.2 → le patient a 1/0.2 (= 5x) plus de chance d’être sain si T-
• Théorème de Bayes / Nommogramme de Fagan
• p (post-test) = p (pré-test) x RV → on a VPP = prévalence x RVP
• Plus le RVP est > 1, plus il augmente la probabilité post-test d’être M+
• Plus le RVN est < 1, plus il augmente la pobabilité post-test d'être M-
• → Nomogramme de Fagan associe p(post-test) à chaque p(pré-test) et RV
• !! Remarque
• Si on veut une VPN ↑ il faut une p (pré-test) assez basse
• exemple = test diagnostique de confirmation
• → D-dimères inutile si la probabilité clinique d’EP élevée
• Si on veut une VPP ↑ il faut une p (pré-test) assez élevée
• exemple = test diagnostique de dépistage
• → pas de dépistage du cancer de l’ovaire par échographie
• Bonnes valeurs pour les RV
• Fort gain diagnostique si RVP > 10 et RVN < 0.1
• Le test est moyen si RVP = 5-10 et RVN = 0.1-0.2
• Le test est mauvais si RVP < 2 et RVN > 0.5
• Intérêts du rapport de vraissemblance
• Indépendant de la prévalence (intrinsèque): ne dépend pas du groupe de patient
• Intérêt individuel en fonction de la probabilité pré-test d’un patient donné
• Valeur différente selon la niveau quantitatif du test

Paramètres faisant varier les indicateurs de performances

• Pour les caractéristiques intrinsèques (Se-Sp)
• seuil de détection du test
• si seuil bas: Se ↑ – Sp ↓ / VPP ↓ – VPN ↑ / RVP ↓ – RVN ↑
• si seuil élevé: tout est inversé
• stade de la maladie / quantité de l’inoculum
• si maladie est avancée ou inoculum important
• Se ↑ – Sp ↓ / VPP ↓ – VPN ↑ / RVP ↓ – RVN ↑
• Pour les caractéristiques extrinsèques (VPP-VPN)
• prévalence de la maladie
• si p ↑ alors VPP ↑ et VPN ↓
• si p ↓ alors VPP ↓ et VPN ↑
• représentativité de l’échantillon
• conséquence directe de ce qui précède